为避免重复建设，申请设立加工区，只能设在已经国务院批准的现有国家级经济技术开发区内，并由省（自治区、直辖市）人民政府报国务院批准。

加工区管委会应是政府部门的派出机构。其本身不能从事其他商业活动。